EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

EnhancerAtlas 2.0 integrated enhancers from 12 high-throupghput technologies including P300, Histone, POLR2A, TF-binding, DHS, FAIRE, Mnase-seq, GRO-seq, STARR-seq, CAGE, CHIA-PET, and MPRA. Users could click any tissue/cell type to view relative enhancers.



Homo sapiens

The species Homo sapiens contains 3871850 enhancers across 196 different tissues, respectively.

786-O (9258)
A375 (10206)
A549 (49760)
AML_blast (565)
Astrocyte (44489)
BE2C (18191)
BJ (3275)
B_cell_blood (4356)
C4-2 (791)
Caco-2 (26695)
Calu-3 (274)
CCRF-CEM (4317)
CD133+ (1812)
CD14+ (895)
CD19+ (25121)
CD20+ (16914)
CD34+ (47306)
CD36+ (434)
CD4+ (14464)
CD8+ (26820)
Cerebellum (17103)
CMK (2318)
CNCC (35537)
Colo320 (1371)
Colo829 (4399)
CUTLL1 (15877)
CyT49 (16414)
DLD1 (1025)
DOHH2 (402)
ECC-1 (31905)
ESC (43128)
ESC_neuron (23486)
ESC_NPC (8453)
Esophagus (36215)
EWS502 (22989)
Fetal_brain (49925)
Fetal_heart (45289)
Fetal_kidney (13949)
Fetal_lung (72683)
Fetal_stomach (72506)
Fetal_thymus (28757)
FT246 (4177)
FT33 (9022)
GC_B_cell (16500)
Gliobla (1342)
GM10847 (8450)
GM12878 (49672)
GM12891 (37461)
GM12892 (26007)
GM18486 (16988)
GM18505 (6998)
GM18507 (17319)
GM18508 (5214)
GM18516 (5531)
GM18522 (7254)
GM18526 (5884)
GM18951 (8895)
GM19099 (1641)
GM19141 (432)
GM19193 (2057)
GM19238 (15394)
GM19239 (17256)
GM19240 (1500)
H1 (58821)
H128 (12099)
H2171 (17372)
H54 (544)
H9 (39732)
HACAT (22022)
HCASMC (38707)
HCC1954 (2971)
HCT116 (4418)
Heart (2797)
HEK293 (13167)
HEK293T (21417)
Hela (13557)
HeLa-S3 (56431)
Hepatocyte (321)
HepG2 (50160)
HFF (39714)
HL-60 (33112)
hMADS-3 (45045)
HMEC (32707)
hNCC (1126)
HSC (23)
HSMM (60216)
HSMMtube (23556)
HT1080 (346)
HT29 (47933)
HuCCT1 (24079)
HUES64 (27035)
HUVEC (63977)
IMR90 (85732)
iPSC (2503)
Jurkat (21360)
K562 (43148)
Kasumi-1 (24413)
KATO3 (5291)
KB (5158)
KELLY (15875)
Keratinocyte (39555)
Kidney (543)
LHCN-M2 (7444)
Liver (20227)
LNCaP (38910)
LNCaP-1F5 (739)
LNCaP-abl (6443)
LoVo (15330)
LP-1 (5775)
LS174T (115)
Lung (22538)
LY1 (3732)
Macrophage (33524)
MCF-7 (23858)
MCF10A (39286)
MDA-MB-231 (29258)
ME-1 (9870)
Melanocyte (1447)
melanoma (33138)
Mesendoderm (65966)
MM1S (2414)
Monocyte (21195)
MS1 (20)
MSC_BM (45184)
Myotube (59800)
Namalwa (3058)
NB4 (19621)
NCCIT (6696)
NGP (3421)
NH-A (12609)
NHBE (28156)
NHDF (15730)
NHEK (44686)
NHLF (19670)
NKC (1241)
NT2-D1 (12020)
OCI-LY1 (12849)
OCI-Ly7 (626)
Osteobl (4241)
Osteoblast (23195)
Ovary (14836)
P493-6 (12554)
PANC-1 (14835)
Pancreas (60477)
PBMC (148)
PC3 (16251)
PrEC (996)
Raji (13591)
Ramos (16388)
REH (703)
Retina (7439)
RPE (3708)
RPTEC (512)
RS4-11 (4194)
SEM (1254)
SH-SY5Y (15440)
SK-MEL-5 (7345)
SK-N-MC (35891)
SK-N-SH (44078)
SK-N-SH_RA (24907)
SkMC (26241)
Sperm (17470)
Spleen (22578)
T47D (32455)
T47D-MTVL (15279)
T98G (9619)
TC-797 (303)
Th1 (26137)
Th2 (13654)
Thymus (3112)
Treg_cell (13599)
Trophoblast (40886)
U2OS (14819)
U87 (37957)
VCaP (7682)
ZR75-1 (32462)
ZR75-30 (22784 )